肛门漏肠即肛管直肠瘘，是肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，主要原因包括：
1.感染：肛管直肠周围脓肿是引起肛瘘的主要原因。绝大多数肛瘘由肛管直肠脓肿破溃或切开排脓后形成。脓肿逐渐缩小，但肠内容物仍不断进入脓腔，在愈合缩小的过程中，常形成迂曲的腔道，引流不畅不易愈合，日久后腔道周围有许多瘢痕组织，形成慢性感染性管道。
2.局部刺激：肛门部不能静养，脓腔不易粘合：排粪、排尿时，因括约肌收缩或因炎症刺激肛门括约肌，使肛门括约肌经常处于痉挛状态。
3.医源性因素：临床上属医源性引起的肛瘘也不少见。①内痔注射误入肌层或手术后感染，产后会阴缝合后感染，前列腺、尿道手术后感染均有可能导致肛瘘。②直肠肛门部位手术，因切取肛管直肠环，留有死腔，若处理不当可导致感染。