新型肺炎病毒来源于野生动物，具体可能是中华菊头蝠。
2020年2月2日，中国科学院西双版纳热带植物园通过官网发布了一篇论文，该论文的第一作者是广西中医药大学的刘利民。研究团队通过分析103株新型冠状病毒的基因组数据，发现新型冠状病毒与一种蝙蝠的冠状病毒序列一致性高达96%。并且，通过对新型冠状病毒的刺突糖蛋白（S蛋白）的结构分析，发现其受体结合位点与蝙蝠冠状病毒的受体结合位点相似性高达96%。这些结果都表明新型冠状病毒很可能来源于蝙蝠。
此外，研究人员还发现新型冠状病毒的传播途径主要是呼吸道飞沫传播和密切接触传播，但在相对封闭的环境中长时间暴露于高浓度气溶胶情况下存在经气溶胶传播的可能。气溶胶和飞沫都是新型冠状病毒的传播途径，因此需要注意个人卫生和防护，避免前往人员密集的场所，勤洗手，佩戴口罩等。