咽喉囊肿微创手术通常在局部麻醉下进行，患者在手术过程中是清醒的，但不会感到疼痛。
这是因为在手术前，医生会给患者使用局部麻醉药物，使咽喉部的神经被暂时阻滞，从而减轻或消除手术过程中的疼痛感觉。此外，微创手术一般采用微创器械，通过口腔或鼻腔进入咽喉部进行操作，相较于传统的手术方式，创伤较小，患者术后恢复也较快。
然而，在手术后，患者可能会感到喉部不适、疼痛和吞咽困难等症状，这是正常的术后反应。医生通常会给患者开一些止痛药和消炎药，以帮助缓解疼痛和不适。
需要注意的是，每个人对疼痛的感受和耐受性都不同，因此在手术前，患者应该与医生充分沟通，了解手术过程和可能的风险，并根据自己的情况做出决策。同时，患者在手术后也需要注意休息和饮食，避免食用辛辣、刺激性食物，以促进恢复。
总之，咽喉囊肿微创手术通常不会引起明显的疼痛，但患者在手术前后仍需要注意相关事项，以确保手术的顺利进行和术后的恢复。如果患者在手术后出现异常症状，应及时就医，以便进行处理。