女性小肚子痛的原因有很多，可能是妇科疾病、内科疾病、外科疾病等，以下是一些常见的原因：
1.排卵性腹痛：青春期女孩在排卵时，卵泡破裂，卵泡液对腹膜可能有一定的刺激作用，所以她们有时会出现左右交替的、每月一次的轻微腹痛。这属于生理性的，表现多为一侧性下腹隐痛、钝痛或坠胀样疼痛，部分少女同时伴有少许阴道出血，即排卵期出血，多在一两天后自行消失，一般不超过七天。这种腹痛多无任何病理改变，妇科检查也完全正常，属于生理性腹痛，一般不需处理。
2.痛经：痛经分原发性与继发性痛经两种。原发性痛经常见于青春期少女，原因与体内前列腺素水平、寒冷、情绪心理因素有关。而继发性痛经常见原因为子宫内膜异位症及子宫腺肌症。表现为疼痛逐渐加重，多呈周期性发作，或非经期下腹有隐痛而行经前后加重。此外，常伴有不孕及月经失调，往往需要药物治疗。
3.卵巢黄体破裂：这是因黄体内出血较多所致，伴有突然发作的下腹部或一侧的腹痛，严重时还可出现休克。卵巢黄体破裂绝大部分发生在月经周期的第20～26天，发病时可出现下腹部疼痛，轻重不一。卵巢黄体破裂的治疗方法因人而异。有过性生活史、月经后半期突发下腹部疼痛的患者，如内出血较多，需急症手术。
4.与妊娠有关的疾病：近年来，少女妊娠的病例并不少见，妊娠相关疾病所致的腹痛可见于先兆流产、异位妊娠等。以宫外孕为例，可出现患侧附件区隐痛或胀痛，当异位妊娠发生流产或破裂时，可引起腹腔内出血。此外，卵巢囊肿蒂扭转、子宫肌瘤红色变性等疾病，也可导致小肚子痛。
5.急性阑尾炎：是一种少女常见的下腹部疼痛，其特点是转移性腹痛，即开始时在上腹部脐周围痛，经几小时或十几个小时后，腹痛转移到右下腹部，多呈持续性疼痛，可有阵发性加重。阑尾穿孔后疼痛可因积聚在腹腔内而减轻，但常伴有发烧、恶心呕吐等症状。
6.与内科疾病有关的腹痛：如肠痉挛、肠炎、胃炎等。这种疾病也会导致女性小肚子痛，疼痛部位多在脐周，一般为阵发性的绞痛，引起肠痉挛的原因有很多，比如饮食不当、消化不良等。
总之，引起女性小肚子痛的原因较多，尤其是青春期少女，更应重视腹痛的原因。如果腹痛持续时间较长，或疼痛逐渐加重，或同时伴有其他症状，如发热、阴道出血等，应及时就医，以便明确诊断，及时治疗。