月经推迟3天且有少量褐色分泌物，可能是以下原因：
1.怀孕：怀孕后卵巢会停止排卵，子宫内膜也不会出现增生与脱落，因此会出现停经，导致女性误以为是月经周期异常或推迟。此时可自行购买验孕棒或早孕试纸检测，如结果为阳性，建议进一步去医院复查，明确诊断。
2.内分泌失调：部分女性可能由于第一次同房，出现紧张、害怕等情绪，并且会精神长时间紧绷，甚至影响睡觉等，则可能导致内分泌失调，以及激素分泌异常，此时则有可能出现月经失调的情况。另外，如果女性日常生活中经常熬夜、压力过大等也会出现相关症状，并不一定是因为第一次同房导致。除月经失调外，还会伴有情绪浮动大、面部油脂分泌过多等症状。
3.妇科疾病：如阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎、子宫肌瘤、子宫内膜异位症等，都可能导致月经推迟和褐色分泌物。这些疾病可能会影响子宫内膜的正常生长和脱落，从而引起月经异常。
4.其他因素：如环境改变、气候变化、情绪波动、过度节食、服用药物等，都可能影响女性的内分泌系统，导致月经推迟和褐色分泌物。
如果出现月经推迟3天且有少量褐色分泌物的情况，建议及时就医，进行相关检查，如B超、性激素六项等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，建议女性保持良好的生活习惯，注意个人卫生，避免过度劳累和精神紧张，有助于维持月经的正常周期。