两侧大腿根疼可能与多种疾病有关，建议就诊以下科室：
1.骨科：大腿根疼可能与髋关节、股骨头、股骨颈等骨骼问题有关，如髋关节滑膜炎、股骨头缺血性坏死、股骨颈骨折等。骨科医生会进行详细的体格检查、影像学检查（如X光、CT、MRI等），以明确病因并制定相应的治疗方案。
2.普外科：大腿根部的疼痛也可能与腹股沟区的疾病有关，如腹股沟疝、股疝、淋巴结炎等。普外科医生会进行腹部检查，如有必要，可能会安排进一步的检查，如超声、血常规等，以明确诊断并进行治疗。
3.妇产科：女性患者两侧大腿根疼还需考虑妇产科疾病，如盆腔炎、宫颈炎、附件炎等，这些炎症可能导致大腿根部牵涉痛。医生会进行妇科检查、B超等检查，以确定病因并给予相应的治疗。
4.血管外科：如果大腿根疼伴有下肢麻木、无力、发凉等症状，可能与血管疾病有关，如动脉硬化闭塞症、血栓性脉管炎等。血管外科医生会进行血管超声、CT血管造影等检查，以评估血管情况并制定治疗方案。
5.神经科：某些神经病变也可能引起大腿根疼，如腰椎间盘突出症、神经炎等。神经科医生会进行神经系统检查，如有必要，可能会安排腰椎磁共振成像（MRI）等检查，以明确诊断并给予相应的治疗。
需要注意的是，以上科室只是常见的可能就诊的科室，具体科室的选择还需根据患者的具体情况、症状特点以及医院的科室设置等因素来决定。在就诊时，应向医生详细描述疼痛的特点、发作时间、加重或缓解因素等，以便医生进行准确的诊断和治疗。此外，在就诊前应尽量避免剧烈运动，保持休息，避免自行用药或采取不适当的治疗方法。