刚查出怀孕肚子隐隐作痛腰疼，可能是以下原因引起：
1.子宫增大：怀孕后，子宫逐渐增大，可能会牵拉腹部和腰部的肌肉、韧带，引起疼痛。这种疼痛通常是轻微的，而且是阵发性的，休息后可以缓解。
2.激素变化：怀孕后，女性体内的激素水平会发生变化，可能会导致身体出现一些不适，如腰疼、肚子疼等。
3.先兆流产：如果肚子疼得比较厉害，或者伴有阴道流血等症状，可能是先兆流产的表现。需要及时就医，进行保胎治疗。
4.宫外孕：如果受精卵没有在子宫内着床，而是在子宫外着床，就会导致宫外孕。宫外孕是一种危险的情况，可能会引起肚子疼、阴道流血等症状，需要及时就医，进行治疗。
5.其他原因：除了上述原因外，肚子隐隐作痛腰疼还可能是由于其他原因引起，如肠胃炎、肾结石等。
需要注意的是，每个人的情况都可能不同，如果出现肚子隐隐作痛腰疼的症状，建议及时就医，进行检查，以确定原因，并采取相应的治疗措施。同时，在怀孕期间，要注意休息，避免过度劳累，保持良好的心态，注意饮食卫生，避免食用辛辣、刺激性食物。