经期同房后肚子疼可能是以下原因引起：
1.感染：经期女性宫颈口张开，此时同房，细菌可能上行感染，引起盆腔炎、子宫内膜炎等，从而出现腹痛。
2.子宫收缩：经期同房时，性兴奋可能导致子宫收缩，引起下腹疼痛。
3.子宫内膜异位症：经期同房可能导致经血倒流，使子宫内膜种植在盆腔其他部位，从而引发子宫内膜异位症，导致腹痛。
4.其他：如男方动作过于粗暴，导致女方腹部受伤，也可能引起腹痛。
如果经期同房后出现肚子疼，建议及时就医，进行相关检查，如B超、血常规等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，经期应避免同房，以免引起感染或其他不适。此外，还要注意经期卫生，保持外阴清洁，避免盆浴和坐浴，注意保暖，避免着凉。