婴儿眼皮上长透明水泡，可能是以下原因引起：
1.汗疱疹：这是一种常见的皮肤病，通常发生在夏季或炎热潮湿的环境中。汗疱疹会导致皮肤出现透明的水泡，可能会出现在眼皮上。可以使用炉甘石洗剂或氧化锌软膏等药物进行治疗。
2.水痘：水痘是由水痘带状疱疹病毒感染引起的一种传染病。水痘初期可出现红斑疹、丘疹、疱疹和结痂等多种形态的皮疹，可伴有发热、头痛、咽痛等症状。如果确诊为水痘，需要注意隔离，避免交叉感染。可以使用阿昔洛韦、伐昔洛韦等药物进行抗病毒治疗。
3.手足口病：手足口病是由肠道病毒感染引起的一种传染病，主要通过密切接触、飞沫传播等方式传播。手足口病可导致手、足、口腔等部位出现皮疹和疱疹，也可能会出现在眼皮上。一般不需要特殊治疗，可自行痊愈。如果症状严重，可使用利巴韦林、干扰素等药物进行治疗。
4.其他原因：婴儿眼皮上长透明水泡还可能与药物过敏、蚊虫叮咬、感染等因素有关。
需要注意的是，由于婴儿的皮肤娇嫩，且免疫系统尚未完全发育成熟，因此如果发现婴儿眼皮上长透明水泡，建议及时就医，由医生进行诊断和治疗，避免自行用药或处理，以免延误病情。同时，要注意保持婴儿皮肤清洁，避免搔抓和感染。