滤泡性角膜炎的治疗方法主要包括以下几种：
1.药物治疗：
抗病毒药物：如利巴韦林滴眼液、阿昔洛韦滴眼液等，可抑制病毒复制，缓解症状。
糖皮质激素：如泼尼松龙滴眼液，可减轻炎症反应，但使用时间不宜过长，以免引起眼压升高。
免疫抑制剂：对于病情顽固的患者，可使用免疫抑制剂，如环孢素A滴眼液等。
2.物理治疗：
热敷：可促进血液循环，缓解眼部不适。
散瞳：如阿托品眼膏，可防止虹膜后粘连。
3.病因治疗：
如因细菌感染引起，可使用抗生素眼药水；因免疫因素引起，可使用免疫抑制剂。
4.手术治疗：
对于病情严重、药物治疗无效的患者，可考虑手术治疗，如角膜移植术。
需要注意的是，滤泡性角膜炎的治疗方法应根据患者的具体情况选择，如病情严重程度、病因、年龄、健康状况等。在治疗过程中，患者应遵循医生的建议，按时用药，注意眼部卫生，避免用眼过度，定期复查，以便及时调整治疗方案。