根据手指甲有凹陷的情况，可能是由以下原因引起：
1.银屑病：这是一种常见的慢性炎症性皮肤病，除了指甲出现凹陷外，还可能伴有指甲增厚、变色、易碎等症状。
2.扁平苔藓：这是一种皮肤和黏膜的慢性炎症性疾病，也可能导致指甲出现凹陷、纵嵴、变色等异常。
3.斑秃：这是一种自身免疫性疾病，除了头发脱落外，也可能影响指甲，导致指甲出现凹陷、纵嵴等异常。
4.湿疹：这是一种常见的过敏性皮肤病，当累及指甲时，可能导致指甲出现凹陷、增厚、变色等症状。
5.感染：某些真菌感染或细菌感染也可能导致指甲出现凹陷、增厚、变色等异常。
6.营养不良：某些营养素的缺乏，如铁、钙、维生素等，也可能导致指甲出现凹陷等异常。
7.其他：某些系统性疾病，如心脏病、肝病、糖尿病等，也可能导致指甲出现凹陷等异常。
需要注意的是，指甲凹陷也可能是其他原因引起，因此，如果发现指甲有凹陷，建议及时就医，进行相关检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。
对于特殊人群，如孕妇、儿童、老年人等，指甲凹陷的原因可能有所不同，需要根据具体情况进行分析和处理。同时，如果指甲凹陷伴有其他症状，如疼痛、肿胀、变色等，或者持续时间较长，建议及时就医，以便早期诊断和治疗。