脚趾头上长透明小水泡，可能是足癣、汗疱疹、湿疹等疾病引起。不同疾病，治疗方法不同，具体分析：
足癣：由真菌感染引起，具有传染性。治疗以抗真菌药物为主，如克霉唑、酮康唑等。同时，要保持足部清洁干燥，勤换鞋袜，避免与他人共用拖鞋、洗脚盆等。
汗疱疹：病因尚不明确，可能与过敏、感染、精神紧张等因素有关。水疱一般不自行破裂，干涸后形成脱皮，可伴有瘙痒或烧灼感。治疗上可外用炉甘石洗剂、糖皮质激素软膏等，瘙痒明显者可口服抗组胺药物。
湿疹：病因复杂，与过敏、免疫、环境等因素有关。表现为红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂等多形性皮疹，常对称分布，瘙痒剧烈。治疗上可外用糖皮质激素软膏、氧化锌软膏等，瘙痒明显者可口服抗组胺药物。
其他：摩擦、烫伤、接触性皮炎等也可导致脚趾头上长透明小水泡。
需要注意的是，以上药物均需在医生的指导下使用，避免自行用药。此外，如果脚趾头上的小水泡症状持续不缓解或加重，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。同时，在治疗期间，应避免搔抓患处，以免引起感染。
对于特殊人群，如孕妇、哺乳期妇女、儿童、老年人等，在使用药物时应格外谨慎，最好在医生的指导下使用。此外，如果患者本身患有其他疾病，如糖尿病、免疫系统疾病等，也应告知医生，以便医生选择合适的治疗方案。