引起发根疼的原因有很多，以下是一些常见的原因：
1.头皮感染：如毛囊炎、疖肿等，可导致发根部位红肿、疼痛。
2.头皮损伤：头皮受到外力损伤，如拉伤、撞伤等，可引起发根疼痛。
3.头皮炎症：如脂溢性皮炎、银屑病等，可导致头皮发红、瘙痒、疼痛。
4.神经系统疾病：如三叉神经痛、枕大神经痛等，可引起头皮放射性疼痛。
5.其他：如紧张性头痛、高血压、颈椎病等，也可能导致发根疼痛。
如果发根疼持续时间较长或伴有其他症状，如头皮瘙痒、红肿、脱发等，应及时就医，进行相关检查，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，应注意保持头皮清洁，避免搔抓、牵拉头发，避免使用刺激性洗发水等。