肛门上方疼可能由多种原因引起，以下是一些常见的病因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。
2.肛周脓肿：肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，主要症状是肛周持续性剧痛，受压或咳嗽时加重，行走不便，坐卧不安。
3.血栓性外痔：肛门缘静脉破裂，血液外渗到结缔组织内，形成血栓，在肛门部皮下隆起一个圆形或椭圆形的肿物，大小不等，位于肛管内或肛缘外。
4.内痔嵌顿：多因内痔脱出未及时回纳，肛管或直肠下端的内痔脱出，嵌顿在肛门外，致使静脉回流受阻，进一步加重肛门局部水肿，使脱出的内痔嵌顿更加严重。
5.肛窦炎：是肛窦及肛门腺内的炎症性病变，多由细菌感染引起，常并发肛乳头炎，使乳头肥大。
6.直肠癌：肛管、直肠的恶性肿瘤，早期无明显症状，随着病情进展，可出现肛门疼痛、大便习惯改变、便血、腹部肿块等症状。
治疗方法因病因不同而异，一般包括以下几种：
1.肛裂：
非手术治疗：保持大便通畅，口服缓泻剂，便后坐浴，外用消炎止痛软膏或栓剂。
手术治疗：若肛裂经久不愈，需手术治疗，包括肛裂切除术和侧位内括约肌切断术。
2.肛周脓肿：
非手术治疗：应用抗生素控制感染，局部理疗，热水坐浴。
手术治疗：切开引流，必要时行挂线疗法。
3.血栓性外痔：
非手术治疗：卧床休息，抬高患肢，局部热敷，外用消炎止痛软膏。
手术治疗：血栓较大，保守治疗无效时，可行血栓外痔切除术。
4.内痔嵌顿：
手法复位：先在肛门部消毒，然后涂上润滑剂，将内痔回纳。
手术治疗：若手法复位失败，需手术治疗。
5.肛窦炎：
保守治疗：口服抗生素，局部坐浴。
手术治疗：肛窦切开引流术。
6.直肠癌：
手术治疗：根据肿瘤的部位、大小、浸润范围等因素，选择不同的手术方式，包括直肠癌根治术、姑息性手术等。
化疗、放疗、靶向治疗等：术后根据病情需要，进行辅助治疗。
总之，肛门上方疼的原因较多，治疗方法也因病因而异。若出现肛门上方疼痛，应及时就医，明确诊断，采取相应的治疗措施。