停经35天有褐色分泌物可能是以下原因引起：
1.先兆流产：如果女性已经怀孕，出现停经35天有褐色分泌物，可能是先兆流产的表现。先兆流产主要与胚胎因素、母体因素、父亲因素和环境因素等有关。此外，剧烈运动、性生活、过度劳累等也可能导致先兆流产。此时需要及时就医，进行超声检查、血HCG和孕酮检测等，以明确诊断。如果是先兆流产，需要注意休息，避免劳累和性生活，并在医生的指导下进行保胎治疗。
2.异位妊娠：受精卵在子宫体腔以外着床称为异位妊娠，俗称宫外孕。停经后阴道流血是异位妊娠的主要症状之一，常发生在停经6~8周左右，多为点滴状，量少，色暗红，一般不超过月经量。如果停经后出现褐色分泌物，同时伴有腹痛、肛门坠胀等症状，需要警惕异位妊娠的可能。此时需要及时就医，进行超声检查、血HCG检测等，以明确诊断。如果确诊为异位妊娠，需要根据病情的严重程度选择保守治疗或手术治疗。
3.月经失调：如果女性没有怀孕，停经35天有褐色分泌物可能是月经失调的表现。引起月经失调的原因很多，如内分泌紊乱、精神因素、环境因素、药物因素、妇科疾病等。此外，营养不良、过度减肥、剧烈运动等也可能导致月经失调。如果是偶尔出现一次月经失调，一般不需要特殊处理，可自行恢复。如果经常出现月经失调，需要及时就医，进行相关检查，以明确病因，并进行针对性治疗。
4.其他：子宫内膜息肉、子宫肌瘤、宫颈息肉等妇科疾病也可能导致停经后阴道流血。此外，服用紧急避孕药、放置宫内节育器等也可能引起月经异常。
总之，停经35天有褐色分泌物可能是多种原因引起的，需要及时就医，进行相关检查，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，女性在日常生活中需要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免感染。此外，还需要注意休息，避免劳累和熬夜，保持心情愉悦，避免紧张和焦虑等不良情绪。