阴茎上方根部长了一个小痘痘可能是多种原因引起的，以下是一些可能的情况：
1.皮脂腺囊肿：这是一种常见的皮肤良性肿瘤，通常是由于皮脂腺分泌过多，导致皮脂在毛囊内积聚形成的。皮脂腺囊肿通常是圆形的，质地较硬，表面光滑，有时会有红肿和疼痛。
2.毛囊炎：这是由于毛囊感染引起的炎症，通常是由于细菌感染引起的。毛囊炎会导致毛囊周围红肿、疼痛，有时会形成脓疱。
3.尖锐湿疣：这是一种由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的性传播疾病。尖锐湿疣通常是菜花状的赘生物，质地柔软，表面湿润，有时会有瘙痒和疼痛。
4.阴茎硬结症：这是一种由于阴茎海绵体纤维化引起的疾病，通常是由于阴茎受到损伤或感染引起的。阴茎硬结症会导致阴茎勃起时弯曲或疼痛。
5.其他：阴茎上方根部长了一个小痘痘还可能是其他原因引起的，如脂肪瘤、血管瘤等。
需要注意的是，以上只是一些可能的情况，具体原因需要通过医生的检查和诊断来确定。如果发现阴茎上方根部长了一个小痘痘，应及时就医，以便确定病因并进行相应的治疗。
对于特殊人群，如儿童、老年人、免疫力低下者等，阴茎上方根部长了一个小痘痘可能需要更加重视。因为这些人群的免疫系统可能较弱，容易感染和发生并发症。此外，对于有性传播疾病风险的人群，如性伴侣不固定、有多个性伴侣、有不洁性行为等，也应及时就医，以便进行相关检查和治疗。
总之，阴茎上方根部长了一个小痘痘可能是多种原因引起的，需要及时就医，以便确定病因并进行相应的治疗。同时，应注意个人卫生，保持阴茎清洁干燥，避免搔抓和挤压痘痘，以免加重病情。