女性感染HPV16后，症状表现多样。部分女性可能无明显症状，仅在体检时发现感染。也有一些女性会出现生殖器部位的异常，如生殖器部位出现疣状赘生物，表现为菜花样、鸡冠样等外观。还可能出现阴道异常出血，在性生活后或非经期出现阴道出血情况。另外，宫颈部位可能发生病变，导致宫颈局部出现糜烂、充血等改变，但这些表现并非特异性，不能仅靠症状来确诊HPV16感染，需要通过专业的医学检测来明确。
无症状感染情况
很多女性感染HPV16后处于无症状感染状态，自身没有任何不适感觉，这种情况是因为人体免疫系统有可能在感染初期就将病毒控制住，暂时没有引发明显的临床症状，但此时体内已存在HPV16病毒，具有传染性。
生殖器疣状赘生物表现
当HPV16持续感染并引起病变时，可能在生殖器部位长出疣状赘生物，这些赘生物的大小、形态各异，初期可能较小，随着病毒持续作用会逐渐增大增多，对生殖器部位的外观和功能可能产生一定影响，并且具有一定的传染性，可通过性接触等途径传播给他人。
阴道异常出血情况
感染HPV16后，阴道异常出血也是常见表现之一，尤其是在性生活过程中，由于局部组织受到刺激，容易引起接触性出血，或者在非经期出现不规则的阴道出血，这是因为HPV16感染可能导致宫颈或阴道黏膜的病变，使得血管变得脆弱，容易破裂出血。
宫颈病变相关表现
HPV16感染还可能引发宫颈病变，在妇科检查中可发现宫颈局部出现糜烂样改变、充血、水肿等情况，不过这些宫颈的外观改变只是辅助判断的依据，最终确诊需要进行宫颈细胞学检查和HPV检测等专业检查来明确宫颈是否发生了高级别病变甚至癌变等情况。