普通防护口罩和医用口罩的主要区别在于用途和过滤效果。
普通防护口罩主要用于防止颗粒物（如粉尘、烟雾等）进入呼吸道，适用于日常生活中的防护，如户外活动、骑行、防尘等。其过滤效果相对较低，通常只能过滤掉较大的颗粒物，对于细小的飞沫和病毒等微生物的过滤效果有限。
医用口罩则是专门设计用于医疗领域，主要用于防止患者的飞沫传播给医护人员和其他人，同时也可以防止医护人员的飞沫传播给患者。医用口罩通常具有更高的过滤效果，可以过滤掉大部分飞沫和病毒等微生物，并且具有更好的密合性和防护性能，能够更好地保护使用者的呼吸道健康。
此外，医用口罩还需要符合相关的标准和规范，如中国的YY/T0969-2013《一次性使用医用口罩》等。而普通防护口罩的标准和规范则相对较为宽松。
因此，在需要防护飞沫和病毒等微生物的情况下，应选择医用口罩。而在日常生活中，普通防护口罩也可以提供一定的防护作用，但对于高风险场合，如医疗机构、疫情防控等，建议选择医用口罩。