肛门出血并伴有疼痛，可能是以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。
2.痔疮：内痔或混合痔发展到一定程度即能引起肛门出血，通常为鲜红色，表现为便后滴血或喷射状出血。
3.肛管或直肠损伤：肛管或直肠因外伤或手术而导致的裂伤，可引起肛门出血和疼痛。
4.肛管直肠肿瘤：肛管直肠癌破溃感染可引起肛门出血和疼痛，血色一般较暗，不像痔疮那样鲜红。
5.直肠炎：如果慢性结肠炎累及到直肠，可以出现肛门下坠感与排便次数增多。一般病程较长，反复发作，病变程度轻重不一。
6.肛乳头炎：是一种良性疾病，常伴有肛门瘙痒，在急性期，肛门乳头炎表现为肛门疼痛和出血。
7.肛门异物损伤：多为外伤异物残留或饮食不当，鱼刺、骨片嵌插肛管直肠所致，故需请医生仔细检查，取出异物，疼痛即能缓解。
8.其他：如溃疡性结肠炎、缺血性肠病等。
总之，肛门出血疼的原因较多，可能是轻微的肛裂或痔疮，也可能是严重的肛管或直肠肿瘤。因此，当出现肛门出血疼的症状时，需要及时就医，进行详细的检查和诊断，以便确定病因并采取相应的治疗措施。