手足口疫苗注射后，一般在24小时内可能会出现发烧的情况。
手足口病是由肠道病毒引起的传染病，多发生于5岁以下儿童，表现口痛、厌食、低热、手、足、口腔等部位出现小疱疹或小溃疡，多数患儿一周左右自愈，少数患儿可引起心肌炎、肺水肿、无菌性脑膜脑炎等并发症。引发手足口病的肠道病毒有20多种（型），其中以柯萨奇病毒A16型（CoxA16）和肠道病毒71型（EV71）最为常见。手足口病疫苗是预防EV-A71感染所致的手足口病最有效的手段。
手足口疫苗注射后，少数孩子可能会出现低热的情况，这是疫苗的一般反应，一般不需要特殊处理，可自行缓解。如果孩子体温超过38.5℃，或出现精神萎靡、食欲不振等不适症状，应及时就医，在医生的指导下使用退烧药（如布洛芬、对乙酰氨基酚等）或进行其他治疗。
需要注意的是，手足口病疫苗并不能预防所有的手足口病，因为手足口病的病毒类型较多，且疫苗的保护效果不是100%。因此，即使孩子接种了手足口病疫苗，家长仍应注意孩子的个人卫生，保持家庭环境清洁，勤洗手，避免带孩子去人员密集的场所，以预防手足口病的发生。