脚趾头上长小水泡的原因可能有以下几点：
1.水疱型足癣：由真菌感染引起，具有传染性。常发生在夏季，表现为脚趾间起小水疱，干涸后脱屑，并逐渐向四周扩大，水疱可融合成大疱，瘙痒明显。搔抓后可继发细菌感染，出现脓疱、渗液、结痂、脱屑等。
2.汗疱疹：病因尚不明确，可能与精神紧张、手足多汗、真菌感染及变态反应等因素有关。夏季多见，表现为深在性小水疱，粟粒至米粒大小，略高出皮肤表面，常无红晕，对称发生于手掌、足跖及指（趾）侧，水疱干涸后会出现脱屑，伴有不同程度的瘙痒、烧灼感。
3.接触性皮炎：是皮肤或黏膜接触某些外界物质后，在接触部位发生的炎症反应。发病急，在接触部位出现红斑、丘疹、水疱等，自觉瘙痒或灼痛。去除病因后，皮损可逐渐消退。
4.湿疹：是由多种内外因素引起的皮肤炎症反应，病因复杂，与过敏、自身免疫、环境、感染等因素有关。表现为多形性皮疹，有渗出倾向，对称分布，瘙痒剧烈，易反复发作。
5.其他：如手足口病、药物过敏、蚊虫叮咬等也可引起脚趾头上长小水泡。
如果脚趾头上长小水泡，建议及时就医，明确诊断后，在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持局部清洁干燥，避免搔抓，以免引起感染。