药物治疗甲亢可能会出现以下副作用：
1.肝损伤：部分甲亢患者在服用药物后可能会出现肝损伤，表现为谷丙转氨酶、谷草转氨酶等指标升高。
2.白细胞减少：药物可能会影响骨髓造血功能，导致白细胞减少，患者可能会出现乏力、发热等症状。
3.皮肤过敏：部分患者可能会对药物过敏，出现皮肤瘙痒、皮疹等症状。
4.胃肠道反应：药物可能会刺激胃肠道，导致恶心、呕吐、腹痛等症状。
5.关节疼痛：少数患者可能会出现关节疼痛。
6.血糖波动：药物可能会影响血糖代谢，导致血糖升高或降低。
需要注意的是，这些副作用并不是一定会发生的，而且在医生的指导下，这些副作用通常可以通过定期检查和调整药物剂量来控制。如果患者在用药过程中出现任何不适症状，应及时告知医生。