三个月大的宝宝晚上哭闹可能由以下原因引起：
1.生理需求：宝宝可能因为饥饿、口渴、尿布湿了或需要换尿布而哭闹。
2.环境因素：宝宝可能对环境不适应，如过热、过冷、过亮或过暗。
3.身体不适：宝宝可能有鼻塞、肚子疼、感冒等身体不适的情况。
4.缺乏安全感：宝宝可能需要更多的安抚和陪伴。
针对这些原因，可以采取以下措施：
1.检查宝宝的生理需求，如饥饿、口渴、尿布等，并及时满足。
2.调整宝宝的环境，保持适宜的温度、亮度和声音。
3.检查宝宝的身体，如有不适，及时就医。
4.给予宝宝更多的安抚和陪伴，如抱抱、拍拍、唱歌等。
如果宝宝哭闹持续时间较长或伴有其他异常症状，如发热、呕吐、腹泻等，建议及时就医，以便确定具体原因并进行相应的治疗。