新生婴儿长胎记的原因如下：
1.胚胎发育过程中，皮肤内的黑素细胞从神经嵴向表皮移行时，由于某种原因未能通过表皮、真皮交界，停留在真皮内，延迟消失所致。
2.可因血清中的锌、铜、钙、镁等微量元素及苯丙氨酸、酪氨酸的严重缺乏，影响了色素合成的生化过程，导致色素细胞分泌色素异常增多，通过神经传导致表皮而逐渐蔓延，就形成胎记。
3.人类皮肤在其真皮层中，一般是没有黑色的，但当局部真皮层里堆积了较多的纺缍状或星状的良性色素细胞时，由于黑色素透过皮肤而呈现灰蓝色，从而使这一小块皮肤表面显示出这种灰蓝色的斑，许多猿猴的皮肤呈青色，也是由同样原因造成的。