阴茎根部皮下出现很多小硬疙瘩，不痛不痒，可能是以下原因引起：
1.皮脂腺异位症：这是一种良性病变，可能与内分泌因素、局部刺激或创伤有关。皮脂腺异位症通常不会引起不适，也不会传染，一般不需要治疗。
2.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，可通过直接接触或间接接触传播。传染性软疣通常表现为半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。治疗方法包括刮除、冷冻、激光等。
3.阴茎珍珠状丘疹：这是一种发生在阴茎冠状沟边缘的丘疹，可能与生理发育变异、局部刺激等有关。阴茎珍珠状丘疹通常没有自觉症状，也不会传染，一般不需要治疗。
4.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。尖锐湿疣通常表现为外生殖器或肛门周围的疣状赘生物，可逐渐增大、增多。治疗方法包括物理治疗、药物治疗、免疫疗法等。
5.其他：阴茎根部皮下的小硬疙瘩还可能是脂肪瘤、纤维瘤、表皮样囊肿等疾病引起。
由于引起阴茎根部皮下小硬疙瘩的原因较多，且可能会影响到生殖健康，因此建议及时就医，进行相关检查，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。
对于有过不洁性行为或多个性伴侣的人，应特别注意排查性传播疾病。此外，保持外生殖器清洁、避免搔抓、避免高危性行为等措施也有助于预防阴茎疾病的发生。