宝宝肛门有个小肉疙瘩，可能是以下原因引起的：
1.痔疮：（痔是肛垫病理性肥大、移位及肛周皮下血管丛血流淤滞形成的局部团块。）如果宝宝排便时间过长、用力过猛，可能会导致肛管处静脉丛压力升高，使肛垫弹性回缩作用减弱，肛垫充血、肥大、下移，从而形成痔疮。
2.直肠息肉：（直肠息肉是指肠黏膜表面突出的赘生物，多因粪便慢性刺激而引起。）可单发或多发，儿童型息肉主要发生于5—10岁儿童，多数息肉为带蒂的圆形或椭圆形肿物，好发于直肠下端，大便时可脱出于肛门外，便后回缩。
3.直肠脱垂：（直肠脱垂是指肛管、直肠黏膜或直肠、部分乙状结肠向下移位，脱出肛门外的一种疾病。）多见于体弱的小儿及老年人，为直肠黏膜、肛管、直肠全层和部分乙状结肠向下移位脱出肛门外的一种疾病。
4.肛裂：（肛裂是齿状线以下肛管皮肤全层的小溃疡。）典型表现为肛门疼痛、便血和便秘，肛门视诊可见肛裂三联征，即肛裂、前哨痔、肛乳头肥大。
如果发现宝宝肛门有小肉疙瘩，建议及时就医，明确诊断后在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持宝宝肛门清洁，便后用温水清洗，避免感染。