发烧头疼不一定是新型冠状病毒感染，也可能是其他疾病引起。以下是一些可能导致发烧头疼的原因：
1.感染性疾病：如感冒、流感、肺炎、脑膜炎等，这些疾病通常由病毒或细菌引起，会导致发热和头疼。
2.自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等，这些疾病会导致免疫系统攻击自身组织，引起发热和头疼等症状。
3.神经系统疾病：如脑炎、脑膜炎、偏头痛等，这些疾病会影响神经系统，导致发热和头疼。
4.血液系统疾病：如白血病、淋巴瘤等，这些疾病会导致白细胞异常增生，释放炎症因子，引起发热和头疼。
5.其他原因：如药物过敏、中暑、中毒等，也可能导致发热和头疼。
如果出现发烧头疼的症状，应及时就医，进行相关检查，如血常规、C反应蛋白、脑电图、脑脊液检查等，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，应注意休息，多喝水，避免劳累和受凉。在疫情期间，如果有接触过确诊或疑似病例，或有发热、咳嗽等症状，应及时就医，并告知医生相关情况，以便进行进一步的排查和治疗。