早晨醒来后总感觉心慌、心情差，可能与以下因素有关。
1.睡眠呼吸暂停综合征：睡眠中呼吸暂停导致缺氧，会引起晨起后心慌、心情差。
2.心脏疾病：如心律失常、冠心病等，可导致心慌、心情差。
3.焦虑、抑郁等心理问题：这些情绪问题可能导致自主神经功能紊乱，引起心慌、心情差。
4.甲状腺功能亢进：甲状腺激素分泌过多，可导致代谢率增加，出现心慌、情绪波动等症状。
5.低血糖：未进食或降糖药物使用不当可引起低血糖，导致心慌、心情差。
6.其他：贫血、过度劳累、咖啡因摄入过多等也可能导致这些症状。
如果这种情况经常发生，或伴有其他症状，如胸痛、呼吸困难、乏力等，应及时就医，进行相关检查，如心电图、心脏超声、甲状腺功能等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，保持良好的生活习惯，如规律作息、均衡饮食、适量运动、减少咖啡因摄入等，也有助于改善症状。
需要注意的是，每个人的情况可能不同，如果对自己的健康状况有疑虑，最好咨询医生的意见。