肾结石碎石后疼痛主要与碎石后结石移动、局部组织损伤及炎症反应等因素有关。
一、结石移动刺激
碎石后，结石碎块会在输尿管内移动，刺激输尿管平滑肌痉挛，从而引发疼痛，这种疼痛多为阵发性，可表现为腰部或腹部绞痛。不同年龄、性别患者感受可能略有差异，但核心是结石碎块移动刺激。
二、局部组织损伤
碎石过程中会对肾脏、输尿管等局部组织造成一定损伤，损伤部位会引发炎症反应和疼痛感觉，年龄较小的儿童可能因表达能力受限，疼痛表现可能不典型，但同样存在组织损伤后的疼痛机制。
三、炎症反应影响
碎石后局部组织的损伤会引发炎症，炎症介质会刺激周围神经，导致疼痛持续或反复，女性在生理期等特殊时期，身体状态不同，对疼痛的感受和反应可能与平时有别，但炎症导致疼痛的机制是共同的。
四、个体差异因素
不同个体对疼痛的耐受程度不同，有些患者可能本身对疼痛较为敏感，碎石后疼痛感觉会相对更明显，同时，有既往肾脏疾病或输尿管疾病病史的患者，碎石后疼痛可能更易发生且恢复相对较慢。