半夜醒来头痛可能由以下原因引起：
1.睡眠呼吸暂停综合征：这是一种在睡眠中反复发生呼吸暂停或低通气的疾病，会导致间歇性缺氧和睡眠中断，从而引起头痛。
2.周期性头痛：这是一种常见的头痛类型，通常与激素水平变化有关，可能在月经期间或绝经期出现。
3.高血压：血压升高可能导致头痛，尤其是在夜间。
4.药物副作用：某些药物可能引起头痛，特别是在夜间服用时。
5.颈椎病：颈椎病变可能压迫椎动脉，导致大脑供血不足，从而引起头痛。
6.心理因素：焦虑、压力、抑郁等心理问题可能导致头痛，尤其是在夜间。
7.环境因素：噪音、光线、温度等环境因素不适可能影响睡眠，进而导致头痛。
8.其他原因：颅内病变、感染、代谢紊乱等也可能引起头痛。
需要注意的是，头痛可能是多种健康问题的信号，也可能是某些疾病的首发症状。如果头痛频繁发作、程度严重、伴有其他症状或持续时间较长，建议及时就医，进行全面的身体检查和评估，以确定具体原因并采取相应的治疗措施。同时，保持良好的睡眠习惯、调整生活方式、避免诱因等也有助于缓解头痛。