月经干净后第二天进行性行为一般不会怀孕，但也不是绝对的。
以下是关于这个问题的具体分析：
1.一般情况下，排卵日通常是在下次月经来潮前的14天左右，而排卵日的前5天和后4天，连同排卵日在内共10天就称为排卵期。月经刚干净时，还处于安全期，此时进行性行为，怀孕的几率较小。
2.但需要注意的是，每个人的月经周期和排卵时间都可能有所不同，而且排卵也可能受到情绪、环境等因素的影响而提前或推迟。此外，精子在女性体内可能存活数天，所以即使在安全期，也不能完全排除怀孕的可能。
3.如果没有怀孕的计划，建议在进行性行为时采取有效的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等。这些方法可以大大降低怀孕的风险，但也不能保证100%的避孕成功率。
4.对于月经周期不规律的女性，或者存在其他影响排卵的因素（如疾病、药物等）的女性，安全期避孕法并不十分可靠。在这种情况下，建议咨询医生或使用其他更可靠的避孕方法。
5.此外，性行为不仅与怀孕有关，还可能传播性传播疾病，如艾滋病、梅毒、淋病等。使用安全套可以在一定程度上预防性传播疾病的传播，但并不能完全杜绝风险。因此，建议保持安全性行为，定期进行性健康检查。
总之，虽然月经干净后第二天怀孕的几率较小，但不能完全排除怀孕的可能。如果对怀孕或避孕有任何疑问，建议咨询医生或专业的医疗机构。同时，也要注意保护自己的性健康，避免不必要的风险。