月经干净后下腹部疼痛可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的原因：
1.排卵性腹痛：
排卵性腹痛是一种生理现象，通常发生在两次月经中间，即排卵期。排卵时，卵泡破裂，卵子排出，卵泡液对腹膜的刺激可能引起下腹部疼痛，一般持续1-2天，可自行缓解。
排卵性腹痛可能伴有少量阴道出血、白带增多等症状。
2.子宫内膜异位症：
子宫内膜异位症是指子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位。异位的子宫内膜在卵巢激素的影响下，也会出现周期性出血，导致下腹部疼痛。
子宫内膜异位症还可能伴有痛经、性交痛、月经失调等症状。
3.盆腔炎性疾病：
盆腔炎性疾病是指女性上生殖道的一组感染性疾病，包括子宫内膜炎、输卵管炎、卵巢炎等。炎症可导致下腹部疼痛、发热、阴道分泌物增多等症状。
盆腔炎性疾病多发生在性活跃的女性，与频繁性生活、多个性伴侣、经期性生活等因素有关。
4.其他原因：
子宫肌瘤、卵巢肿瘤等妇科疾病也可能引起下腹部疼痛。
肠道疾病、泌尿系统疾病等也可能导致下腹部疼痛。
如果月经干净后下腹部疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，进行相关检查，如B超、血常规、妇科检查等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在日常生活中，要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免经期性生活，避免过度劳累和剧烈运动。