熬夜是否会影响身高，以及第二天个子矮了是否与熬夜有关，目前并没有科学研究能够明确证实。
身高主要取决于遗传因素和后天的营养、运动等因素。在青少年时期，生长激素的分泌对于身高的增长至关重要，而生长激素通常在夜间睡眠时分泌较为旺盛。因此，保持充足的睡眠时间和良好的睡眠质量对于身高的发育是有一定帮助的。
然而，熬夜本身并不会直接导致个子矮了。如果熬夜导致了睡眠不足或睡眠质量下降，可能会对身体的正常发育产生一定的影响，但这种影响通常是长期积累的结果，而不是在熬夜的当天就会立即显现出来。
此外，如果第二天感觉个子矮了，可能是由于以下原因：
测量误差：测量身高时的姿势、测量工具等因素可能会导致测量结果的差异。
身体疲劳：熬夜可能会导致身体疲劳，使得身体的伸展度和灵活性下降，从而给人一种个子矮了的感觉。
心理因素：熬夜可能会影响情绪和心理状态，导致焦虑、紧张等情绪，进而影响身体的感觉和表现。
为了确保身高的正常发育，建议保持良好的生活习惯，包括：
充足的睡眠时间：尽量保证每天8-9小时的睡眠时间，并且要保持规律的作息时间。
合理的饮食：摄入均衡的营养，包括蛋白质、维生素、矿物质等。
适度的运动：适量的运动可以促进骨骼的发育和健康。
良好的心态：保持积极乐观的心态，避免过度压力和焦虑。
需要注意的是，身高的发育是一个复杂的过程，受到多种因素的影响。如果对于身高的发育存在疑虑或担忧，建议咨询医生或专业的营养师，以获取更准确和个性化的建议。同时，也要注意不要过分关注身高问题，保持健康的身心状态才是最重要的。