灵芝孢子粉具有一定调节免疫的作用，多项研究表明其可在一定程度上增强机体的免疫功能，帮助免疫系统更好地发挥作用；还可能对肝脏有一定保护作用，能在一定程度减轻肝脏损伤等情况；另外，部分研究显示其可能对改善睡眠有一定帮助，有助于提高睡眠质量，但具体效果因个体差异有所不同。
调节免疫方面
灵芝孢子粉中的有效成分能对免疫系统的多个环节产生影响，比如可以促进免疫细胞的增殖和活化，像T淋巴细胞、B淋巴细胞等免疫细胞在灵芝孢子粉作用下活性可能得到提升，从而增强机体抵御外界病菌等侵害的能力，不过不同人群初始免疫状态不同，效果会有差异。
保护肝脏作用
一些动物实验等研究发现，灵芝孢子粉能够通过多种途径保护肝脏，它可以减轻肝脏受到的氧化损伤，因为肝脏在代谢等过程中会产生自由基等有害物质，灵芝孢子粉中的成分能清除部分自由基，减少对肝细胞的损伤；还可能调节肝脏的代谢功能，帮助肝脏更好地进行各项生理活动，但这一作用在不同个体上体现程度有别。
改善睡眠功效
有研究提示灵芝孢子粉可能通过调节神经系统等方式来改善睡眠，它或许能让大脑神经处于相对稳定、放松的状态，有助于人们更快进入睡眠状态并且延长深度睡眠的时间，不过睡眠状况受多种因素影响，比如心理压力、生活习惯等，所以其对睡眠的改善效果因人而异，并非所有人都能获得相同程度的改善。
对于特殊人群，比如孕妇、儿童等，孕妇使用灵芝孢子粉需要格外谨慎，因为目前关于孕妇使用灵芝孢子粉对胎儿是否有影响的研究还需进一步明确，为了安全起见一般不建议随意使用；儿童由于其身体发育尚未完全成熟，对灵芝孢子粉的耐受性等情况不明，也不建议盲目使用灵芝孢子粉来改善相关状况，特殊人群在考虑使用灵芝孢子粉时最好先咨询专业医生的意见。