小三阳患者能否办理健康证，需要根据具体情况来判断。小三阳是指乙肝五项检查中乙肝表面抗原（HBsAg）、乙肝e抗体（HBeAb）和乙肝核心抗体（抗HBc）阳性，但乙肝病毒DNA载量较低或检测不到。
一般来说，如果小三阳患者的肝功能正常，没有肝炎症状和体征，且乙肝病毒DNA载量较低或检测不到，是可以办理健康证的。因为这些情况下，患者的传染性较低，不会对他人造成感染风险。
然而，如果小三阳患者的肝功能异常，或有肝炎症状和体征，如乏力、食欲减退、恶心、呕吐、腹胀、黄疸等，或者乙肝病毒DNA载量较高，说明患者的传染性较强，可能会对他人造成感染风险，此时则不能办理健康证。
需要注意的是，不同地区的健康证办理要求可能会有所不同，具体情况建议咨询当地的卫生健康部门或相关医疗机构。此外，小三阳患者应定期复查肝功能、乙肝病毒DNA载量等指标，以及时了解病情变化，并在医生的指导下进行治疗。同时，患者应注意个人卫生，避免与他人共用牙刷、剃须刀等可能导致血液传播的物品，避免饮酒，避免过度劳累，保持良好的生活习惯。