怀孕三个月同房是否会影响胎儿发育，需要根据具体情况来判断。一般来说，只要孕妇和胎儿的情况稳定，适量的同房不会对胎儿发育造成不良影响。但如果孕妇存在以下情况，同房可能会对胎儿发育产生影响：
1.习惯性流产：既往有习惯性流产史的孕妇，宫颈机能不全，同房时可能会刺激子宫收缩，导致再次流产。
2.前置胎盘：胎盘位置较低，附着在子宫下段或覆盖在子宫颈内口处，同房时可能会导致阴道出血，增加感染的风险，影响胎儿发育。
3.胎膜早破：胎膜早破是指在临产前胎膜自然破裂，同房可能会导致上行感染，引起宫腔内感染，影响胎儿发育。
4.其他高危因素：如孕妇患有妊娠期高血压、糖尿病、心脏病等，同房时可能会加重病情，影响胎儿发育。
因此，对于怀孕三个月的孕妇，是否可以同房，需要综合考虑孕妇和胎儿的情况。如果孕妇和胎儿的情况稳定，可以适当同房，但要注意以下几点：
1.动作轻柔：避免过于激烈的动作，以免刺激子宫。
2.注意卫生：同房前后要注意清洁卫生，避免感染。
3.避免压迫腹部：不要压迫孕妇的腹部，尤其是胎盘位置较低的孕妇。
4.注意观察：同房后要注意观察孕妇的身体状况，如果出现阴道出血、腹痛等异常情况，应及时就医。
总之，怀孕三个月同房是否会影响胎儿发育，需要根据具体情况来判断。如果孕妇有任何疑虑或担忧，建议咨询医生的意见，以确保孕期安全。