皮肤上长了两个小肉疙瘩，可能是丝状疣、扁平疣、皮赘等疾病。以下是一些可能的原因和治疗方法：
一、病因
1.丝状疣由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起。主要通过直接接触传染，搔抓会使疣体自身接种，从而越长越多。
2.扁平疣也是由HPV感染引起。可通过直接或间接接触传播，外伤或皮肤破损对HPV感染也是一个重要的因素。
3.皮赘是一种良性肿瘤，可能与遗传、皮肤老化、肥胖等因素有关。一般认为皮赘的形成是由于皮肤的纤维组织过度增生所致。
二、治疗方法
1.丝状疣和扁平疣可以采用冷冻、激光、电灼等物理治疗方法。也可以外用药物治疗，如咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等。
2.皮赘一般不需要治疗，如果觉得影响美观，可以通过激光、电灼、手术切除等方法去除。
三、注意事项
1.避免搔抓疣体，以免造成自身接种。2.注意皮肤清洁，避免感染。3.如果疣体数量较多或症状严重，建议及时就医。4.治疗后要注意护理，避免感染和复发。
总之，皮肤上长小肉疙瘩可能是多种疾病引起的，建议及时就医，明确诊断后采取相应的治疗方法。同时，要注意个人卫生，避免感染，保持皮肤清洁。