早晨醒来眼睛肿的原因可能有以下几种：
1.睡前饮水过多：如果在晚上睡觉前大量饮水，水分会在体内潴留，导致眼睛肿。
2.睡眠姿势不当：如果睡觉时枕头过低，头部血液循环不畅，也可能导致眼睛肿。
3.过敏：如果对某种食物、化妆品、药物等过敏，可能会引起眼睛肿。
4.肾脏疾病：肾脏是人体的排泄器官，如果肾脏功能出现问题，导致水钠潴留，也可能引起眼睛肿。
5.心脏疾病：心脏功能不全时，也可能导致血液循环不畅，引起眼睛肿。
6.其他：如甲状腺功能减退、系统性红斑狼疮等疾病，也可能引起眼睛肿。
如果经常出现早晨醒来眼睛肿的情况，建议及时就医，进行相关检查，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，在日常生活中，应注意保持良好的睡眠姿势，避免睡前大量饮水，注意饮食健康，保持心情愉悦。