复方玄驹胶囊的起效时间存在个体差异，一般来说，多数患者可能在服用2 - 4周左右开始有一定效果，但具体还需根据病情等因素而定。
病情轻重不同影响起效时间
病情较轻者，可能相对较早看到效果，也许服用2周左右就能察觉身体某些不适症状有所改善；而病情较重的患者，可能需要更长时间，比如4周甚至更久才能逐渐显现出效果。这是因为病情严重程度不同，身体对药物的反应以及药物发挥作用来调整机体状态的过程所需时间不一样。
个体差异影响起效时间
不同患者的体质、对药物的敏感性等存在个体差异。有些患者对复方玄驹胶囊较为敏感，可能服用较短时间就会有效果；但也有部分患者可能对药物的敏感性较低，起效时间就会相对延长。例如，年轻、体质较好且对药物反应敏感的患者可能比年老、体质较弱且对药物反应不敏感的患者起效更快。
用药依从性影响起效时间
如果患者能严格按照医嘱规律服用复方玄驹胶囊，不随意停药或更改剂量，那么药物能持续发挥作用，相对更有利于较快起效；反之，如果患者用药不规律，时断时续，就会影响药物在体内的持续作用，从而延长起效时间。比如忘记服药或者自行减少服药次数等情况，都会对药物起效产生不利影响。
伴随疾病等因素影响起效时间
若患者除了相关病症外还伴有其他基础疾病，这些基础疾病可能会干扰复方玄驹胶囊的起效。例如，同时患有其他慢性疾病的患者，身体整体状态较为复杂，药物发挥作用可能会受到一定影响，导致起效时间延长。所以有其他基础疾病的患者在服用复方玄驹胶囊时，起效时间可能与单纯病症患者有所不同。