如果平时月经周期规律，一般在停经50天左右就可以看到胎心胎芽。如果在停经50天左右做超声检查，孕囊有卵黄囊，但是没有胎芽及胎心搏动，可能与以下因素有关。
1.实际受孕时间晚：虽然末次月经已经停经50天，但是排卵延迟，受孕时间晚，孕囊内的胎芽及胎心搏动出现的也会晚。可以先暂时观察，一周后复查超声。
2.胚胎发育不良：如果孕囊的平均直径大于25mm时，仍然没有胎芽及胎心搏动，或者是空孕囊，提示胚胎发育不良，没有保胎的必要，需要及时清宫终止妊娠。
3.稽留流产：如果既往月经周期规律，孕囊的平均直径大于25mm时，没有胎芽及胎心搏动，或者是空孕囊，并且孕囊内已经有胎芽组织，但是没有卵黄囊，这种情况考虑是稽留流产，也需要及时清宫终止妊娠。
4.其他：孕妇年龄过大、卵子质量下降、精子质量差、染色体异常、接触有毒有害物质等，也可能会导致胚胎发育不良。
总之，如果在孕囊有卵黄囊的情况下，没有胎芽及胎心搏动，需要结合末次月经、停经时间、血hcg、孕酮等情况综合判断，必要时需要清宫终止妊娠。