宝宝卤门闭合晚的原因主要有以下几点：
1.遗传因素：如果父母或家族中有囟门闭合晚的情况，宝宝也可能会出现这种现象。
2.维生素D缺乏性佝偻病：由于维生素D缺乏，导致钙磷代谢异常，会影响囟门的闭合。
3.脑积水：由于脑脊液循环障碍，颅内压增高，可使囟门延迟闭合。
4.呆小症：由于甲状腺功能减退，骨骼发育障碍，也会导致囟门闭合延迟。
5.其他：如脑发育不良、宫内感染、颅内出血等也可能导致囟门闭合晚。
如果发现宝宝囟门闭合晚，应及时带宝宝到医院就诊，进行相关检查，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。