孕39周流出透明黏液，可能是以下原因引起：
1.宫颈黏液栓排出：孕晚期时，子宫颈会逐渐变软、变短，为分娩做准备。此时，子宫颈管内的黏液栓会脱落，排出体外，表现为透明或略带黄色的黏液分泌物。这是正常的生理现象，通常不需要特殊处理。
2.胎膜早破：胎膜早破是指在临产前胎膜破裂，羊水流出。胎膜早破时，孕妇会感觉到阴道突然有大量液体流出，通常是清澈、无味的。胎膜早破可能会导致感染、早产等并发症，需要及时就医。
3.其他原因：孕妇可能还会因为其他原因出现透明黏液分泌物，如阴道炎、宫颈炎等。
需要注意的是，无论出现哪种情况，孕妇都应该及时就医，进行检查和诊断。医生会根据具体情况，给出相应的处理建议。同时，孕妇在孕晚期要注意休息，避免过度劳累和性生活，注意个人卫生，保持外阴清洁。如果出现腹痛、阴道流血、流水等异常情况，应立即就医。