第五跖骨基底部骨折可能会留下以下后遗症：
1.疼痛：骨折后可能会出现疼痛，尤其是在活动或负重时。如果骨折没有得到很好的治疗或恢复，疼痛可能会持续存在。
2.肿胀：骨折后周围组织会肿胀，这是正常的反应。但如果肿胀持续时间较长或严重，可能会影响关节活动和日常生活。
3.畸形：如果骨折没有得到正确的复位和固定，可能会导致畸形，如足弓塌陷、足外翻等。
4.僵硬：骨折后长时间固定会导致关节僵硬，影响关节活动范围。
5.肌肉萎缩：由于骨折后需要休息，运动量减少，可能会导致肌肉萎缩，影响肢体力量。
6.创伤性关节炎：如果骨折愈合不良或不愈合，可能会导致创伤性关节炎，出现关节疼痛、肿胀等症状。
7.长期疼痛：部分患者可能会出现长期的疼痛，尤其是在天气变化或劳累后。
8.行走困难：如果骨折严重或后遗症严重，可能会影响行走功能。
为了减少第五跖骨基底部骨折的后遗症，需要及时就医，进行正确的治疗和康复。治疗方法包括休息、固定、物理治疗、药物治疗等。在康复期间，需要注意休息，避免过度活动，按照医生的建议进行康复训练。如果出现后遗症，需要及时就医，进行进一步的治疗。