小便时有精子流出，可能与以下原因有关：
1.逆行射精：正常情况下，精液会从尿道口射出体外。但如果患有某些疾病，如前列腺增生、前列腺炎等，可能导致尿道括约肌收缩无力，精液会逆行进入膀胱，随着尿液排出体外。
2.遗精：如果长时间没有性生活，或者受到性刺激，可能会出现遗精现象，精液也会随着尿液排出体外。
3.其他原因：精囊炎、附睾炎等疾病也可能导致精液异常，出现小便时有精子流出的情况。
如果出现这种情况，建议及时就医，进行相关检查，如前列腺液常规、精液常规等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意个人卫生，避免过度劳累和精神紧张，保持良好的生活习惯。