牙齿牙根发黑可能是以下原因导致的：
1.龋齿：（1）如果口腔清洁不到位，食物残渣在细菌的作用下发酵、产酸，会逐渐腐蚀牙釉质和牙本质，形成龋洞，导致牙齿变黑。（2）龋齿进展到中晚期时，龋洞可能累及牙髓，导致牙髓坏死，进而使牙齿变色。
2.牙髓坏死：（1）牙齿受到外伤、龋齿等外力或疾病的影响，牙髓组织可能会发生炎症或坏死，从而使牙齿失去血液供应，颜色变暗。（2）牙髓坏死后，细菌会分解牙髓中的血红蛋白，产生黑色素，导致牙齿变黑。
3.四环素牙：（1）在牙齿发育期间，服用了四环素类药物，如四环素、金霉素等，这些药物会与牙齿组织结合，导致牙齿变色，呈现出棕灰色或灰黑色。（2）四环素牙一般发生在恒牙，但乳牙较少受累。
4.氟斑牙：（1）如果饮用水中氟含量过高，会导致牙齿在发育过程中受到氟的影响，出现白垩色或褐色斑块，严重时甚至会导致牙齿缺损。（2）氟斑牙多见于恒牙，但乳牙较少受累。
5.吸烟：（1）长期吸烟会使烟草中的尼古丁、焦油等有害物质沉着在牙齿表面，使牙齿变黄、变黑。（2）此外，吸烟还会导致口腔卫生状况恶化，增加患龋齿、牙周病等口腔疾病的风险。
6.其他原因：（1）牙齿表面的牙结石、牙菌斑等附着物也会使牙齿看起来发黑。（2）一些系统性疾病，如肾上腺皮质功能减退症、某些金属中毒等，也可能导致牙齿变色。
如果发现牙齿牙根发黑，建议及时就医，进行口腔检查和诊断。医生会根据具体情况采取相应的治疗方法，如洗牙、补牙、根管治疗、烤瓷牙等。同时，保持良好的口腔卫生习惯，定期洗牙，有助于预防牙齿疾病的发生。