月经结束后有褐色分泌物，可能是以下原因导致：
1.黄体萎缩不全：(1)月经周期正常，但经期延长，(2)出血量少，(3)褐色分泌物持续时间长。
2.子宫内膜息肉：(1)多发生在育龄期女性，(2)常表现为经间期出血，(3)息肉较大时可导致经量增多、经期延长。
3.子宫内膜炎：(1)多发生在育龄期女性，(2)有下腹疼痛、白带增多等症状，(3)也可导致月经异常，出现经期延长、经间期出血等。
4.宫内节育器：(1)部分宫内节育器放置后，(2)可出现经间期出血，(3)一般出血量少，(4)不伴有其他不适。
5.其他：(1)排卵期出血：出血量少，(2)一般持续2-3天，(3)可伴有下腹坠胀感。(2)宫颈癌、子宫内膜癌等：(3)也可导致阴道不规则出血，(4)常伴有其他症状，(5)如性交出血、阴道分泌物异常等。
如果出现月经结束后有褐色分泌物，建议及时就医，完善相关检查，如B超、性激素六项等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免过度劳累和剧烈运动。