药流不干净还来月经的原因和影响主要有以下几点：
1.药流不完全：药流后如果子宫内有残留的胚胎组织，会导致子宫无法正常收缩，从而引起出血和月经不调。
2.感染：药流后如果不注意个人卫生，容易引起细菌感染，导致子宫内膜炎等炎症，从而影响月经。
3.内分泌失调：药流会影响女性的内分泌系统，导致激素水平失衡，从而引起月经不调。
4.其他因素：药流后过度劳累、情绪波动、生活不规律等因素也可能导致月经不调。
如果药流不干净还来月经，建议及时就医，进行B超检查等，以确定子宫内是否有残留组织。如果有残留组织，需要进行清宫手术，以清除子宫内的残留物。同时，还需要进行抗感染治疗，以预防感染的发生。
此外，药流后需要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免性生活和盆浴，以免引起感染。同时，需要注意休息，避免过度劳累和情绪波动，保持生活规律，以促进身体的恢复。