下半夜全身发热的原因可能有以下几种：
1.自主神经功能紊乱：自主神经功能紊乱可导致全身发热，还可能伴有多汗、手抖、心悸等症状。长期压力、紧张、焦虑、疲劳等因素可能诱发自主神经功能紊乱。
2.感染：感染是导致全身发热的常见原因之一。下半夜人体免疫力相对较弱，容易受到感染。例如，细菌、病毒、真菌等感染都可能引起发热。此外，结核病、慢性肾盂肾炎等疾病也可能导致长期低热。
3.内分泌疾病：某些内分泌疾病也可能引起全身发热，如甲状腺功能亢进。甲状腺功能亢进时，甲状腺激素分泌过多，可导致代谢率增加，产热增多，出现发热症状。
4.风湿免疫性疾病：风湿免疫性疾病如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等也可能导致全身发热。这些疾病可累及多个系统和脏器，引起发热、关节痛、皮疹等症状。
5.恶性肿瘤：恶性肿瘤也是导致全身发热的原因之一。某些恶性肿瘤如白血病、淋巴瘤等可导致体内炎症反应，引起发热。
6.药物反应：某些药物如抗生素、抗抑郁药等可能引起药物反应，导致全身发热。
7.其他：环境温度过高、剧烈运动后、女性生理期等也可能导致下半夜全身发热。
如果下半夜全身发热的症状持续时间较长或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行详细的检查和诊断。医生可能会根据具体情况进行相应的检查，如血常规、C反应蛋白、自身抗体检测、影像学检查等，以明确病因，并给予相应的治疗。同时，保持良好的生活习惯，如合理饮食、适量运动、充足睡眠等，有助于提高身体免疫力，预防疾病的发生。