两肾都有结石的治疗方法主要包括以下几种：
1.保守治疗：如果结石较小，没有引起明显的症状，可以通过保守治疗来排出结石。保守治疗的方法包括多喝水、多运动、饮食调整等。多喝水可以增加尿量，促进结石排出；多运动可以帮助结石排出体外；饮食调整可以减少结石的形成。
2.药物治疗：如果结石引起了疼痛或其他症状，可以使用药物来缓解症状。常用的药物包括止痛药、消炎药、排石药等。
3.体外冲击波碎石：体外冲击波碎石是一种非侵入性的治疗方法，通过体外冲击波将结石击碎，然后排出体外。该方法适用于直径小于2厘米的结石。
4.输尿管镜取石或碎石：输尿管镜取石或碎石是一种微创手术，通过输尿管镜将结石取出或击碎。该方法适用于输尿管结石。
5.经皮肾镜取石或碎石：经皮肾镜取石或碎石是一种微创手术，通过经皮肾镜将结石取出或击碎。该方法适用于肾结石。
需要注意的是，治疗方法的选择应根据结石的大小、位置、数量、症状等因素来决定。在治疗过程中，应注意饮食调整，避免食用富含草酸、钙等物质的食物，同时应定期复查，以了解结石的治疗情况。如果结石治疗后再次出现，应及时就医，以便采取进一步的治疗措施。