眼睛底下长小疙瘩，可能是以下原因引起：
1.粟丘疹：可由遗传、外伤、皮肤附属器受损等因素引起。一般无自觉症状，通常不需要治疗。如果影响美观，可由医生消毒后用针挑破表皮，剔出内容物，然后涂红霉素软膏等，以预防感染。
2.汗管瘤：与遗传有关，可由创伤或内分泌紊乱引起。通常表现为眼睑周围的粟粒大小丘疹，部分患者可累及面部、胸背部等部位。一般不需要治疗，如果觉得影响美观，可通过激光、冷冻等物理方法去除。
3.扁平疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，可通过直接或间接接触传播。主要表现为米粒至黄豆大小的扁平丘疹，颜色为正常肤色或淡褐色，好发于面部、手背、前臂等部位。可通过外用药物、物理治疗、手术治疗等方法去除疣体。
4.皮脂腺囊肿：由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。好发于头面部、背部等部位。如果继发感染，可出现红肿、疼痛等症状。一般需要手术切除。
5.脂肪瘤：由成熟的脂肪组织构成，可发生于身体任何有脂肪的部位。好发于肩、背、颈、乳房和腹部，其次为四肢近端。通常为单个或多个皮下局限性肿块，也可有弥漫性肿胀。一般不需要治疗，如果影响美观或出现疼痛等症状，可手术切除。
如果眼睛底下的小疙瘩持续不消失或逐渐增大，建议及时就医，明确诊断后进行相应的治疗。同时，要注意保持皮肤清洁，避免搔抓、挤压，以免引起感染。